LEGO Star Wars III: The Clone Wars заснований на мультсеріалі "Зоряні війни: Війни клонів". Як завжди, гра повторює сцени з оригіналу, замінюючи все та всіх на цеглинки LEGO. Це також привносить гумор у гру тому, що конструкції LEGO є крихкими.