Befunginum/Бефунгін призначають як допоміжний засіб у складі комплексної терапії хронічних гастритів, виразкової хвороби шлунка та дванадцятипалої кишки без загострення, дискінезії кишечника за гіпотонічним типом (в т.ч. закрепів), хронічних гепатитів (в т.ч. станів, що супроводжуються жировою інфільтрацією печінки), хвороби Крона, ожиріння, псоріазу, нейродерматозів, екземи, вугрів, бородавок, аденоми простати, а також як симптоматичний засіб, який покращує загальний стан у онкологічних хворих.